המחירים נקבעים בצו פיקוח על המחירים — כלומר אלה לא מחירים "חופשיים" שמכוני הטסט קובעים כרצונם, אלא תעריף מפוקח ואחיד שמתעדכן מעת לעת על ידי משרד התחבורה.
ההבדל בין מחיר רכב פרטי (כ-122-126 ₪) לאופנוע (כ-80 ₪) ולרכב חשמלי (כ-106 ₪) משקף בעצם את ההיקף וההיקף של הבדיקה הנדרשת לכל סוג רכב — רכב חשמלי, למשל, לא דורש בדיקת מערכות הקשורות למנוע בעירה פנימית שרכב רגיל כן דורש (כמו בדיקות פליטה), מה שעשוי להסביר חלק מההבדל במחיר.
הכדאיות הכלכלית של הטסט החוזר הממוקד (כ-29-30 ₪, משמעותית זול מהטסט המלא) היא בדיוק הסיבה שמומלץ מאוד לנצל את האפשרות הזו אם נכשלתם: תיקון הליקוי הספציפי ובדיקה חוזרת של אותו סעיף בלבד, תוך 7 ימים באותו מכון, זול בהרבה מתשלום מחדש על טסט מלא מההתחלה. זו עוד סיבה טובה לא "לוותר" ולתכנן טסט חוזר מלא (תוך 30 יום, בכל מכון) אם אפשר לנצל את המסלול הממוקד והזול יותר.